Appena si entra in chiesa lo sguardo è attirato subito dal grande Cristo in gloria dipinto nel catino dell'abside principale inquadrato nei simboli degli evangelisti (aquila = Giovanni, leone = Marco, angelo = Matteo, toro = Luca), su cui plana la colomba dello Spirito.

Egli siede ieratico come un sovrano, con la destra benedice mentre con la sinistra regge sul ginocchio un libro aperto dal quale viene proclamata la solenne iscrizione "ego sum alfa et O(mega), primus et novissimus".
 
Entro l'emiciclo absidiale la coorte con Desiderio offerente il modello della basilica e con il nimbo rettangolare intorno alla testa, gli arcangeli Gabriele, Michele e Raffaele dalle belle ali aperte e le vesti costellate di oreficeria. San Benedetto, ridipinto, con il libro in mano della regola su cui si legge "ausculta o fìlio".

Sull'arco trionfale dovevano esserci due angeli; se ne intravede solo uno a sinistra.